邱楼在游集街西南3公里处。据史料和族谱记载：邱楼原来的庄名叫丘家楼，清雍正三年（公元1725年）为避至圣先师孔丘讳而加“阝”，同时为简便而成邱楼。

明末崇祯年间，始祖邱孟江兄弟三人为避战乱带着家人从花园家（今江苏省睢宁县境内）一路南行寻找安身之地。先到今灵璧北马厂湖一带，不久辗转北行又走到现在邱楼。当时邱楼遍地沼泽，芦苇遮天。兄弟三人只能选择高地搭棚栖身，并拓垦荒地，种些蔬菜杂粮，而生活主要靠捕鱼捞虾。

随着时间的推移，人口的繁衍，兄弟中的老二孟林西迁五里建庄，这就是邱圩(今朱集乡苗河村)也叫西邱楼。老三孟三则南迁近四十里在南湾(今杨疃镇双河)建庄，老大孟江在原地居住。一直延续至今。

清康熙五年（公元1665年），邱氏一族传至三代，在三世祖思斌的带领下家业逐渐壮大，后来发展到拥有良田千亩，骡马成群，家奴院工齐全，成为富甲一方的富家大户。遂斥巨资在庄子中间择吉地建造了六间三层楼房，三进出的大院，约二亩的后花园，相当气派大方，大家都称为“邱家楼”。思斌在家业大业大以后就有恃无恐、妄自尊大，把朝廷的法度置之度外。也是为了摆谱，请工匠斥巨资建了约十亩地的响场，这一下可是犯了官府的大忌。当时官府规定，打响场必须达到一定的官职地位或被州府授于干顷的大户，并在官府登记备案后方可具备打响场的资格。三世祖思斌不听劝阻执意而为，而遭到扒楼、抄家、蹲监坐牢的悲惨结局。楼房虽然消失，但邱楼的庄名依在，从此叫开了。

在清朝光绪年间，邱楼曾出过一个岁贡生，姓邱名玉佩字润玖。此人从小聪颖过人，头脑灵活，读书识字过目不忘，14岁便考中秀才(廪生)。按其学识本可以继续攻读考取更好功名，可偏偏其伯父邱麟误伤母亲至死，被官府判处死刑而受到株连，耽误了功名，直到清光绪19年(1890年)50岁上才被推举为岁贡生。

贡生玉佩是邱氏9世孙，生于1840年，卒于1921年，享年八十岁。一生以教学为生，教书育人，门生众多。时值乱世，捻军作乱，散尽家财，家道中落，郁郁而逝。去世前自拟碑文留传后世。

邱思祖碑文摘录：
世业耕读，勤俭是尚，存心施济，洵足仪型后人。至余少时，先君教读，必令夙夜伏案，伦常日用之礼，谆谆讲说。遭捻匪之乱，不得安居，二老皆逝，未得终养，于今抱憾。迨壮年平定多故，身世匆匆，转瞬而五十出矣。后命运多舛，复遭乱世，贼徒蜂起，家资贻尽，幸得全生。盖以中年旬，回忆生平，善无半点，过有千般，吾已往之非，期今日之世，第恐桑榆暮景，车薪之火，杯冰莫能胜耳。转切望尔等看破迷途，知不忠不信皆无，实为恶易为善难。无才无识，不勤不俭，败家易而守家难；待父母如路人，子孙悖逆；视兄弟如仇敌，头自谁捍？耕田不竭力，饥寒交迫；言行不谨慎，悔亦难矣。疏远小人，身心无他，辩比群少，邪妄渐趋。上则玷辱先人，下则贻累妻子，为人此戒之，其亦可矣。勿效区区，马到他年，始恨收成之晚也。

清朝末年社会动荡不安，农民起义风起云涌，盗贼横行，为保证百姓生命财产安全，由地方乡绅出资在村庄周围挖出宽15米深3米长约1000米的壕沟，挖出的泥土在沟内堤坝上筑起约高三米厚80厘米的圩墙。

东西建有宽5米的圩门，安装两扇大木门。白天开放，傍晚关闭，有专人轮流值班，晚上除非特殊情况，无任何人不能出入。庄人每晚有人打更，打更的人称更夫，直到抗战结束，圩门及圩墙才逐渐损毁倒塌，圩壕至今保存完好，仍然起着防旱排涝的作用。

抗日战争时期，游集伪保安大队长刘夫廷为解决游集到时村的交通运输问题，组织民工修建了可供汽车行驶的游集至宿县时村镇公路，途径邱楼庄穿庄经过。驴驮担挑的、溜乡卖货的、收购杂品的，长途贩运的，整天人来人往，川流不息。从此，邱楼百姓借助交通便利、人流密集的条件，先后有数家从事商业经营活动。其中较为有名的有邱全孝的酒坊，邱德君的油坊，邱元朴的旅店，老鸡框子的小吃，邱全申的甜货篮子，邱重元的油炸，邱德财的日用品店等等。直到解放后随着时游公路的改道，商户服务业活动才逐渐衰退。

新中国成立前，邱楼设立过联保，邱元吉、邱敬玉、邱全孝、邱德钧、邱德财等乡贤都曾先后担任过保长或联保长。

新中国成立后，先后是乡政府(辖张楼、邱楼、林圩、邱圩等行政村)，大队(辖林圩、张楼、邱楼)，行政村(原邱楼林圩二个大队合并)所在地。邱楼村有完全小学校，三层教学楼共有标准教室20余个。二十世纪七十年代曾办过联中，先后有四届学生约200名学生在此修完各门课程毕业。

2005年以后，邱楼村先后实施了国家农业综合开发、美好乡村建设等项目。完成环村、环农田水泥混凝土公路15000米，打机井130余眼，建装机容量超过200千瓦的电力排灌设施三座，修建农田桥涵120座，铺设标准化混凝土路面22000平方米，建农民文化休闲广场约3900平方米，村综合服务中心大楼960平方米。以土地增减挂钩方式新建村民住宅小区15幢，入住73户。通过招商引资建起了村办服装厂，吸纳200人就业。新建道路旁的绿化带并栽种了红叶石楠、冬青、樱花、黄洋、广玉兰等花木，使冬天有绿，春夏秋冬有花，从根本上美化了村庄，美化了道路。村庄路旁安装了太阳能路灯120盏。村庄面貌、村庄环境发生了翻天覆地的变化，得到了省市县各级领导的充分肯定，也得到了广大党员干部和群众的拥护，同时也获得周边村群众的称赞和羡慕。